时空转录基因组学
时空转录基因组学(Spatially Resolved Transcriptomics, SRT)是近年来发展迅速的一个研究领域,它结合高分辨率的空间位置信息和转录组测序技术,以解析组织或细胞中基因表达的空间分布和时间变化。
时空转录基因组学作为一项前沿技术,在发育生物学、肿瘤研究、神经科学、免疫学研究、再生医学、药物研发、疾病模型构建等多个生物医学领域展现出广泛的应用潜力。
深圳华大生命科学研究院(以下简称华大研究院)作为时空转录基因组学领域的主要推动者之一,在2022年联合多名科学家在《Cell》上发表了题为《Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball patterned arrays》的研究论文,结合 DNA 纳米球 (DNB) 模式阵列和原位 RNA 捕获来创建空间增强分辨率组学测序 (Stereo-seq)。应用Stereo-seq生成小鼠器官发生时空转录组图谱(MOSTA),以单细胞分辨率和高灵敏度绘制了小鼠器官发生过程中转录变异的动力学和方向性。这一创新性的图谱不仅深刻揭示了细胞间差异的分子根源,还清晰展现了大脑组织发育过程中的微妙变化,为探索遗传性疾病的复杂发病机制提供强有力的工具。
麦克奥迪助力时空转录基因组学研究
值得一提的是,此次时空转录基因组学的研究专题成果,离不开高性能显微镜这一关键工具的助力——麦克奥迪PA53扫描系列显微镜。
麦克奥迪PA53扫描系列显微镜,为华大研究院的科研人员提供了洞察微观世界的窗口。无论是生物样本的精细结构解析,还是基因表达产物的直观可视化,PA53扫描系列显微镜都能以优异的光学性能、精准的成像技术和人性化的操作设计,助力时空转录基因组学研究的深入发展。
麦克奥迪助力时空转录基因组学研究
PA53扫描系列是麦克奥迪光学公司自主研发设计的数字切片显微镜扫描平台,它将传统的玻璃切片进行扫描和无缝拼接,生成包括传统玻璃切片内所有信息的全视野的数字化切片。目前,该系列显微镜被广泛应用于生物样品的观察和分析、研究生物医学材料与组织的相互作用、基因表达与检测等领域,为科研和医学诊断提供重要的手段和方法。
参考资料:
[1] Mengnan Cheng et al., Spatially resolved transcriptomics: a comprehensive review of their technological advances, applications, and challenges. Journal of Genetics and Genomics(2023).
[2] Ao Chen et al., Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball-patterned arrays. Cell (2022).